เรื่องราวของสาวน้อย

เราจะได้รับบทเป็นสาวน้อยธรรมดาๆคนนึงซึ่งอาศัยอยู่กับเจ้าอาวาสซึ่งเป็นปู่ของเธอที่วัดแห่งหนึ่ง จู่ๆวันนึงก็มีกลุ่มนินจาปรากฏตัวขึ้นต่อหน้าเรา เราก็เลยจะลองไปถามปู่ดูว่าพอจะรู้อะไรเกี่ยวกับเรื่องนี้ไม๊ ก็ไปเจอปู่อยู่กับนินจาคนนึงซึ่งกำลังคุยเรื่องที่ "โนบุนางะ(Nobunaga)" กำลังคิดที่จะทำลายล้างเผ่าพันธุ์นินจาให้สิ้นซาก ปู่ก็บอกเราว่าจริงๆแล้วเราคือผู้สืบทอดตำแหน่งนายหญิงของกลุ่มนินจาเนื่องจากเราเป็นทายาทของนินจาตระกูลคุสุโนคิ(Kusunoki)ซึ่งเป็นนินจารุ่นบุกเบิกที่นินจาทุกคนต่างก็ให้ความเคารพนับถือ ดังนั้นพวกนินจาจึงต้องการให้เราเป็นตัวแทนที่จะทำให้นินจาทุกกลุ่มรวมตัวกันเพื่อร่วมต่่อสู้กับโนบุนางะ หน้าที่ของเราในตอนนี้ก็คือไปที่หมู่บ้านไอกะ(Iga)เพื่อไปรวมกลุ่มกับพวกนินจาที่รวมตัวกันอยู่ที่นั่นแล้วโดยให้เลือกไปกับนินจา 1 ใน 5 คนเพื่อให้มาเป็นบอดี้การ์ดและเป็นครูฝึกสอนทักษะนินจาแก่เราด้วย